2021年5月，本土爆發多件新冠肺炎（COVID-19）確診案例，大批確診個案以及準備篩檢的民眾紛紛湧入醫院，對於醫療院所而言是極大的考驗，萬芳醫院作為重症急救責任醫院，守在防疫最前線，疫情期間共收治確診住院個案183人，現已康復回家。萬芳醫院防疫指揮官陳作孝院長及重症醫學科石智元主任，兩位醫師在防疫期間付出的心力獲台北市醫師公會的肯定，於2021年11月6日醫師節前夕獲頒「防疫貢獻獎」。
陳作孝院長自2020年1月3日緊急召開並啟動防疫應變小組，當時以醫務副院長身分擔任指揮小組肩負防疫大任，而在2021年疫情嚴峻之際，陳院長以一年多來對抗COVID-19的經驗，領導防疫應變小組為院內訂定良好的防疫政策，落實感染管制措施，並配合政府防疫政策，順利地進行精準而且務實的防疫工作，並整合以胸腔科、感染科、急重症單位、心血管外科等專科醫師，成立COVID-19專家小組，即時為感染個案作治療的建議，並配合疾病管制署特殊傳染性肺炎COVID-19疫情期間，轉送國人返國就醫申請與國際醫療援助政策，制定收治流程並落實執行，親臨防疫現場督導與鼓勵一線防疫同仁收治返國民眾與友邦人民事務。【左圖：萬芳醫院陳作孝院長（右）與石智元醫師（左）在防疫貢獻獎典禮現場合影】
石智元醫師為胸腔內科主治醫師暨重症醫學科主任，防疫期間擔任防疫專責病房/專責ICU總指揮官角色，督促本院專責病房/專責ICU開設，為能隨時掌握確診/疑似個案人數與病況，石醫師與感染管制室及資訊室合作，建置COVID-19 Command Center系統（專責病房/專責ICU/疑似及確診個案監測儀表板），讓專責病房/ICU團隊能完整且具邏輯性地掌握病人病況，有效輔助調節專責病房/專責ICU精準調度運用，並隨時掌握確診/疑似個案人數，調配全院專責病房/專責ICU床位，並負責調度專責醫師人力，以保持最佳醫療能量，提供病人最佳醫療照護。（文/萬芳醫院）【下圖：2021台北市醫師公會防疫貢獻獎得主合影】
