教育部體育署為活絡大專校院體育活動、增進大學生身體健康，特配合高教司、技職司將「體育衡量指標」納入大專校院績效補助，自106學年度起迄今已辦理3年，填報學校共計152校，僅臺北醫學大學及銘傳大學兩校，連續3年獲得滿分的好成績。
體育運動資料庫填報分為8大項目共59項填報指標，國內152所大專校院每年9月提報各指標執行情形，由體育署邀請體育專家學者審查，指標總計滿分10分，其中體育課程開設情形佔4分，學校體育設施（備）現況、學校辦理運動活動與賽事及增進學生體適能等佔6分。106學年度有40所學校、107學年度有35所學校，108學年度有31所學校積分達到8分以上。
體育署為感謝本校推展體育不遺餘力，並期盼將學校體育推動理念及經驗作為他校的學習標竿，特於2021年5月6日在體育署召開記者會公開表揚並頒發感謝狀，本校由朱娟秀副校長從體育署林哲宏副署長手中接獲感謝狀，並在記者會中向大家分享北醫大推展學校體育理念與推動方式。【左圖：朱娟秀副校長（左）代表北醫從體育署林哲宏副署長（右）手中接獲感謝狀】
朱副校長表示，臺北醫學大學以培育具人文關懷、創新能力及國際觀的生醫人才為教育宗旨，特別重視同學們在校的人文素養培育，而體育競賽團體活動正是學習與人相處、溝通協調，培養團隊合作、問題解決、危機處理等軟實力的最佳方法之一，故非常鼓勵同學們參與體育活動及運動團隊。除此之外，本校亦十分重視學生終生運動習慣的養成，故體育課程實施興趣選項與3年必修的策略，希望同學於畢業前能通過游泳與自救能力檢定、至少精熟1種運動項目，培養享受運動樂趣的能力。【左圖：本校橄欖球隊充滿汗水與衝撞，堪稱運動美學的經典（蔡銘哲醫師攝影）】【右圖：北醫大的創意啦啦舞競賽已成為年度盛事】
為了落實各項體育業務推動，北醫大於2011年將原體育室（二級單位）提升為體育事務處（一級單位）的行政架構，積極提升體育教學品質、推動全面優質化體適能輔導、強化運動團隊輔訓及建構多元化運動設施等方面，並同時配合體育署相關政策推動。
雖然本校是醫學大學，但在體育的表現上卻從不落人後，在全國大專盃、全國醫學盃及各專項比賽等都有過亮眼成績，於2012年起開始邁開腳步，每年積極辦理「北醫體育菁英會」，串聯起創校60年來以北醫體育系自居的校友，與在校師生的連結與傳承，在校友們熱心的捐資下，造就了「甲組橄欖球隊」與「北醫體育後援會」的發展。此外，每年亦積極參與國際體育競賽與學術交流等活動，展現多面向的體育發展。
同時，本校於2015、2018年兩度榮獲教育部頒發「體育績優學校」，體育績優學校獎堪稱學校體育團體最高榮譽，代表北醫大在體育課程、教學、活動與運動校代表隊之選、訓、賽、輔及行政與服務，具有卓越績效。北醫體育多年來在大家齊心努力下締造了許多佳績與成果，期待所有教職員生、校友與北醫一起努力，能培育更多文武雙全的學子，傳承創新、服務社會。（文/體育事務處）【右圖：2018年11月由林建煌校長（右）代表學校接受教育部林騰蛟次長頒獎】【下圖：體育署長官與獲獎學校團隊合影】
